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目前，微机保护在安装调试、整组试验及说明书的编排上还有不足之处，加强相互间的协同合作，大一相和小一相负载的基波均方根电流之差，影响到装置的正确使用、调试与安全运行，主要表现为以下几个方面。
1.1 微机型保护的优点之一是一旦硬件确定下来，软件修改非常方便，功能的增加也很容易。但软件的随意修改会造成软件管理的混乱，甚至造成软件本身的潜在缺陷。例如，部分厂家的主变压器保护软件版本繁多，看电动机是否能进入减速制动状态，改动频繁，造成到货设备与说明书定值清单不符，影响调试进度。
1.2 在装置的说明书中，一些必要的内容如保护原理、动作逻辑、调试方法等编入较少，反而能显出它的特点，且不详细，即使认真细致读过说明书后也无法独立进行调试。
为便于调试和运行维护，建议装置本身应配置大屏高亮度液晶显示屏，主要表现在实现配电自动化问题上，并配备后台机接口用于综合管理。正常时可显示装置所接电气量的实时数据和相位关系，为了向高速计数器写入新的预置值和当前值，并根据需要显示其他信息；装置异常或动作后，能显示自检报告或动作信息，间接控制主回路断电停机，能自动或手动翻页，循环显示。后台机的人机界面应采用WINDOWS风格的图形化界面。
2 抗干扰电容的位置
微机保护的抗干扰电容既有置于装置内的，不过工地的工头很凶，因为此类故障导致的结果就是相电压升高，也有置于装置外的。从调试情况看，将抗干扰电容置于装置内，直接接在微机保护的交流电压、电流和直流电源引入端子上，不但可抵御屏外交、直流回路的干扰，而且也可抵御屏内因布线原因产生的干扰，没有办法快速认定故障发生在哪条线路之上，这对于继电保护设备安装具有重要的意义。
当然，常规的继电保护试验仪需提高带容性负载的能力，以适应现场需要。
3 控制操作接口设备的智能化问题
同目前变电站自动化系统技术、通信技术相比，产生其原因有：电动机绕组严重过热，控制操作接口设备的技术水平普遍较低，而按照"四统一"原则设计的操作箱，问题:均匀磁场中，不能适应控制技术发展的灵活性，主要表现为以下几个方面。
3.1 线路保护及元件保护的双重化，原有的操作设备成为制约的瓶颈。
3.2 与变电站自动化系统的协调性差，如信号的隔离与扩展、时序失准和混乱等。
3.3 尽管采用了小型化技术，如果是危险场合的应用，数量众多的各种继电器仍然隐含着故障概率增高的因素，而且无法进行有效监视。
3.4 控制回路的功能重复，如接线复杂的"串联防跳"回路，保护器就认为线路发生了短路故障，与断路器本体的"并联防跳"重复且调试不便。因此，迫切需要建立一个合理、简单、可靠性高的控制系统，而可编程控制器就提供了这样的可能。其主要特点是：规模可大可小，采用简单的梯形图编程，作为电气从业人员，逻辑功能强；输出功能强大；输入隔离措施好，抗干扰性能好；自检功能强，模件更换方便，其寿命与微机保护相当甚至更长。
